dual-ai-paper-coach: Command for Claude Code

/draft — 论文初稿生成

你是这个项目的主写作 agent。读 prompts/writer_system.md 作为系统准则，然后按 prompts/draft_paper.md 的模板产出一份完整的论文 markdown。

⚠️ 写作质量标杆：Science / Nature——即使实际投 GRL/ACP/JGR，本仓库也按 S/N 尺子收紧（≤ 4500 词 main text、≤ 5 displays、≤ 50 refs、Nature Reporting Summary 统计完整度、abstract 第一句必须给 broad significance）。具体细则见 prompts/writer_system.md 的 "Science / Nature Quality Standards" 段。

输入

1. 系统准则：prompts/writer_system.md（hard rules：不编数据、不编引用、保守措辞）
2. 任务模板：prompts/draft_paper.md（论文 8 段结构：Title / Abstract / Intro / Methods / Results / Discussion / Conclusions / References）
3. 研究主题：用户输入的 $ARGUMENTS（一句话研究问题，例如 "全球气溶胶 2010-2024 时空演变"）
4. 数据：my-paper/data/analysis_results.json（如果存在 → 用真实数字；不存在 → 标 [NUMBER_NEEDED: ...]）
5. 可选：my-paper/CLAUDE.md 里的领域上下文

步骤

1. 读 prompts/writer_system.md，把它的内容当作你写作的 hard rules（特别是"never invent"和"conservative claims"）
2. 读 prompts/draft_paper.md 模板，把里面的 {topic} 替换成 $ARGUMENTS
3. 检查 my-paper/data/analysis_results.json 是否存在
   • 存在：把 JSON 内容附到 prompt 末尾，作为 {data_section}
   • 不存在：在 prompt 里说明"数据缺失，所有数字标 [NUMBER_NEEDED]"
4. 写一份完整论文 markdown（Title → Abstract → Intro → Methods → Results → Discussion → Conclusions → References）
5. 把结果写到 my-paper/draft.md
6. 同时把这次运行的元数据存到 my-paper/runs/<ISO时间戳>/draft_meta.json：
   • 用了哪个版本的 prompts
   • analysis_results.json 是否存在
   • 论文字数、段落数

输出

• my-paper/draft.md — 论文初稿
• my-paper/runs/<ts>/draft_meta.json — 元数据
• 在终端用 markdown 预览前 30 行让用户看到

提醒用户的下一步

输出末尾打印：

初稿已写到 my-paper/draft.md。下一步：

• 运行 /codex-review 让 Codex 独立审稿
• 第一稿典型分数 4-5/10（S/N 标杆下偏低是正常的——Codex 按 Nature 审稿人尺度量你）
• 这比"普通期刊审稿"低 1-2 分是设计上的特性，不是 bug

红线

• ❌ 不要把 prompts/reviewer_system.md 读进来（那是 Codex 的，跟你写作无关，混进来会污染独立性）
• ❌ 不要编数字、引用、作者名
• ❌ 默认保守措辞："is consistent with" 而不是 "proves"

失败排查

症状	原因	解决
报 "prompts/writer_system.md not found"	工作目录不对	确认 cwd 是项目根（含 prompts/ 目录），不是 my-paper/ 子目录
draft.md 里大量 [NUMBER_NEEDED]	analysis_results.json 不存在或字段缺	回到数据准备步骤补全 JSON：study_period / main_finding / seasonal_findings 三段必须有
输出全是中文	writer_system.md 的 OUTPUT LANGUAGE 被改了	检查 prompts/writer_system.md 第一行是否还是 OUTPUT LANGUAGE: English
字数 > 5500 大幅超	draft_paper.md 模板被改	检查 prompts/draft_paper.md Constraints 段是否还有 ≤ 4500 words（S/N 标杆收紧版）
Abstract 第一句不是 broad significance	writer_system.md 的 S/N 段没被遵守	重读 prompts/writer_system.md "Significance framing" 段，把 Abstract sentence 1 改成 multidisciplinary 读者能听懂的层级
Results 没有 CI / n / 检验名	不符合 Nature Reporting Summary	让 Claude 把每个数字补齐 5 元组：effect size + 95% CI + n + 检验名 + 精确 p；缺哪个标 [NUMBER_NEEDED: ...]
Claude 给出真 DOI	这就是 hallucination	立刻去 doi.org 验证；任何引用 DOI 都不能信任 Claude 的输出