empiricalwiki: Skill for Claude Code

/ideate

基于 wiki 知识库和外部搜索，通过 5 阶段管道生成高质量研究 idea。 Phase 1 扫描研究景观（wiki + WebSearch + S2），Phase 2 双模型脑暴（Claude + Review LLM 独立生成）， Phase 3 初步筛选（可行性 + 快速 novelty），Phase 4 深度验证（调用 /novelty + /review）， Phase 5 写入 wiki（ideas/ + graph edges），包括被淘汰的 ideas（记录原因作为 anti-repetition 记忆）。

Inputs

• direction（可选）：研究方向、关键词或具体问题描述。若不指定，则从 open_questions.md 自动选择最有价值的方向。
• --max-ideas N（可选，默认 3）：最终写入 wiki 的 idea 数量上限
• --skip-validation：跳过 Phase 4 深度验证（快速模式，仅做 Phase 1-3 + Phase 5）
• --auto：全自动模式，不暂停等待用户确认（用于 /research 调用）

Outputs

• wiki/ideas/{slug}.md — 每个 idea 一个页面（status: proposed），包含 top ideas 和被淘汰的 ideas
• wiki/graph/edges.jsonl — 新增 idea → claim/gap 的关系边
• wiki/graph/context_brief.md — 重建后的压缩上下文
• wiki/graph/open_questions.md — 重建后的知识缺口图
• IDEA_REPORT（输出到终端）— 管道执行摘要、排名结果、novelty 评分

Wiki Interaction

Reads

• wiki/graph/context_brief.md — 全局上下文
• wiki/graph/open_questions.md — 知识缺口，驱动 idea 方向
• wiki/ideas/*.md — 已有 ideas，特别是 status=failed 的 ideas 及 failure_reason（banlist）
• wiki/claims/*.md — 当前 claims 状态，识别 weakly_supported 和 challenged claims
• wiki/papers/*.md — 已有论文方法和结果
• wiki/concepts/*.md — 技术概念，寻找跨领域组合机会
• wiki/topics/*.md — 研究方向地图，SOTA 和 open problems
• wiki/experiments/*.md — 已有实验结果，避免重复

Writes

• wiki/ideas/{slug}.md — 创建新 idea 页面
• wiki/graph/edges.jsonl — 添加 idea → claim/gap 的关系边（addresses_gap, inspired_by）
• wiki/graph/context_brief.md — 重建
• wiki/graph/open_questions.md — 重建
• wiki/log.md — 追加操作日志

Graph edges created

• addresses_gap：idea → claim/topic（idea 针对的知识缺口）
• inspired_by：idea → paper/concept（idea 的灵感来源）

Workflow

前置：

1. 确认工作目录为 wiki 项目根（包含 wiki/、raw/、tools/ 的目录）
2. 检查 wiki 成熟度：

   python3 tools/research_wiki.py maturity wiki/ --json
   

   根据 maturity level 调整后续行为：
   • cold：Phase 1 外部搜索扩展（WebSearch 查询从 5 增至 8，S2/DeepXiv limit 从 20 增至 30）， 跳过 wiki 内部上下文加载（为空无意义），标注 "cold-start mode: heavier external search"
   • warm：标准行为（当前默认）
   • hot：Phase 1 外部搜索缩减（WebSearch 查询从 5 降至 2，S2/DeepXiv limit 从 20 降至 10）， Phase 3 gap_alignment_bonus 从 +2 提升到 +3，优先解决 wiki 中已有的 weak claims
3. Snapshot wiki 状态（用于结束时的 Growth Report）： 保存 maturity 返回的 JSON 到内存变量 maturity_before